Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf1Q9EPU0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upf1Q9EPU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf1Q9EPU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms