Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms