Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ap3s1Q9DCR2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap3s1Q9DCR2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms