Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc38a3Q9DCP2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc38a3Q9DCP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms