Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syvn1Q9DBY1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syvn1Q9DBY1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syvn1Q9DBY1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms