Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc97Q9DBT3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms