Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SelenooQ9DBC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SelenooQ9DBC0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms