Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chmp2aQ9DB34 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp2aQ9DB34 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms