Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms