Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4bQ9D8B3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms