Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpap3Q9D706 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpap3Q9D706 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms