Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calml3Q9D6P8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calml3Q9D6P8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms