Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdr42e1Q9D665 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr42e1Q9D665 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms