Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930548H24RikQ9D496 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930548H24RikQ9D496 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930548H24RikQ9D496 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms