Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Odf2lQ9D478 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Odf2lQ9D478 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Odf2lQ9D478 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Odf2lQ9D478 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Odf2lQ9D478 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Odf2lQ9D478 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Odf2lQ9D478 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2lQ9D478 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Odf2lQ9D478 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Odf2lQ9D478 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms