Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D454 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D454 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D454 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D454 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D454 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D454 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D454 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D454 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D454 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D454 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D454 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D454 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D454 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D454 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D454 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D454 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D454 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D454 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D454 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D454 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D454 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D454 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D454 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D454 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D454 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D454 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D454 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D454 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D454 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D454 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D454 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D454 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D454 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D454 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D454 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D454 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D454 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D454 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D454 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D454 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D454 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D454 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D454 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D454 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D454 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D454 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D454 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D454 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D454 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D454 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D454 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D454 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D454 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D454 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D454 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D454 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D454 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D454 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D454 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D454 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D454 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D454 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D454 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q9D454 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D454 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D454 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D454 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D454 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D454 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D454 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D454 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D454 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms