Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph14Q9D3W1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsph14Q9D3W1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms