Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc6bQ9D289 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms