Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lingo1Q9D1T0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms