Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MrnipQ9D1F5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MrnipQ9D1F5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms