Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan11Q9D1D1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tspan11Q9D1D1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan11Q9D1D1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms