Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbed3Q9D0L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed3Q9D0L1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbed3Q9D0L1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms