Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RpainQ9CWY9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RpainQ9CWY9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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