Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrxn1Q9CS84 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nrxn1Q9CS84 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nrxn1Q9CS84 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nrxn1Q9CS84 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms