Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700029F12RikQ9CRB4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms