Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp5sQ9CRA7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp5sQ9CRA7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms