Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vta1Q9CR26 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vta1Q9CR26 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vta1Q9CR26 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms