Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PompQ9CQT5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PompQ9CQT5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms