Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd5Q9CQP3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd5Q9CQP3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chchd5Q9CQP3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms