Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Asf1aQ9CQE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Asf1aQ9CQE6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Asf1aQ9CQE6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms