Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab5aQ9CQD1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms