Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sar1bQ9CQC9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sar1bQ9CQC9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1bQ9CQC9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms