Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ubl4bQ9CQ84 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ubl4bQ9CQ84 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ubl4bQ9CQ84 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ubl4bQ9CQ84 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ubl4bQ9CQ84 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ubl4bQ9CQ84 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms