Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl49Q9CQ40 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mrpl49Q9CQ40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl49Q9CQ40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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