Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Bcl11bQ99PV8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Bcl11bQ99PV8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Bcl11bQ99PV8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Bcl11bQ99PV8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Bcl11bQ99PV8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms