Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scd3Q99PL7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Scd3Q99PL7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scd3Q99PL7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms