Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx4Q99NE9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbx4Q99NE9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms