Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll1Q99NC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll1Q99NC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms