Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atoh8Q99NA2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atoh8Q99NA2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms