Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col25a1Q99MQ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col25a1Q99MQ5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col25a1Q99MQ5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms