Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd3Q99MJ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd3Q99MJ6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd3Q99MJ6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd3Q99MJ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms