Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99LU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99LU8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99LU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99LU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99LU8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99LU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99LU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99LU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99LU8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99LU8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99LU8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99LU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99LU8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99LU8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99LU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99LU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99LU8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q99LU8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q99LU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q99LU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99LU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99LU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99LU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99LU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99LU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99LU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99LU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99LU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99LU8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99LU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99LU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99LU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99LU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99LU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q99LU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q99LU8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q99LU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99LU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99LU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99LU8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99LU8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99LU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99LU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q99LU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q99LU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99LU8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99LU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99LU8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99LU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q99LU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99LU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99LU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99LU8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99LU8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99LU8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q99LU8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99LU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99LU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99LU8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99LU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99LU8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms