Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cstf3Q99LI7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cstf3Q99LI7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cstf3Q99LI7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms