Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lims1Q99JW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lims1Q99JW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lims1Q99JW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lims1Q99JW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lims1Q99JW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lims1Q99JW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lims1Q99JW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lims1Q99JW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lims1Q99JW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lims1Q99JW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lims1Q99JW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lims1Q99JW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lims1Q99JW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms