Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrbp1Q99J45 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nrbp1Q99J45 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrbp1Q99J45 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms