Protein–RNA interactions for Protein: Q923S9

Rab30, Ras-related protein Rab-30, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab30Q923S9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab30Q923S9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab30Q923S9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab30Q923S9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab30Q923S9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab30Q923S9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab30Q923S9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab30Q923S9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab30Q923S9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.8 ms