Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha9Q91Y11 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha9Q91Y11 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha9Q91Y11 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms