Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prb1Q91X93 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prb1Q91X93 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prb1Q91X93 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms