Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trub2Q91WG3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trub2Q91WG3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms