Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zkscan3Q91VW9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zkscan3Q91VW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zkscan3Q91VW9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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